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【人民政协网】首个半野生型甜瓜T2T基因组组装成功

来源:人民政协网 作者:高志民 2023-12-07 16:44:00 浏览量:

人民政协网12月7日电(记者 高志民)近日,开云官网app-手机登录 甜瓜遗传育种与栽培团队联合国内有关科研院校对半野生型甜瓜“821”进行了高质量T2T基因组组装,为揭示甜瓜抗性相关基因和品质改良提供了重要遗传资源。

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甜瓜是一种重要的园艺经济作物,其多样性丰富。长期的人工选育致使一些相关性状基因丢失,栽培品种的遗传多样性显著少于野生种,在一定程度上限制了对甜瓜抗性基因及优质性状的发掘。

该研究首先完成了其单倍型T2T基因组的组装,通过基因组比较发现,在11号染色体存在基因拷贝数的变异,其中2个自噬基因与新德里病毒抗性显著相关。此外,通过全基因组关联分析,发现1个与果实成熟相关的显著信号,并鉴定出候选基因CmABA2,其编码一个细胞质短链脱氢酶,参与脱落酸的生物合成。该研究提供了高质量的半野生甜瓜基因组,为甜瓜抗性基因的挖掘和品质改良提供了遗传资源。

该研究得到中国农业科学院科技创新工程、国家现代农业产业技术体系、海南省重点研发计划等项目支持。相关研究成果发表在《园艺研究(Horticultural Research)》上。


 

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